เมื่อ 13 ก.ย. ที่ทำเนียบรัฐบาล นายวิษณุ เครืองาม รองนายกรัฐมนตรี ให้สัมภาษณ์กรณีหัวหน้าคสช.ออก คำสั่งที่ 55/2559ให้ยกเลิกการนำคดีความมั่นคงมาขึ้นศาลทหาร โดยให้กลับไปอยู่ในอำนาจการพิจารณาของศาลยุติธรรมว่า คดีตามความผิดมาตรา 112 มาตรา 116 เกี่ยวกับวัตถุระเบิด อาวุธปืน ดอกไม้เพลิง และคดีที่เกี่ยวกับการขัดคำสั่ง คสช. ที่จากเดิมให้ขึ้นศาลทหาร เปลี่ยนให้มาขึ้นศาลยุติธรรมหรือศาลพลเรือนแทน โดยมีผลตั้งแต่วันที่ 12 ก.ย.2559  ที่มีการประกาศใช้คำสั่งหัวหน้า คสช.หากมีการกระทำผิดก็จะต้องไปขึ้นศาลพลเรือน  ส่วนคดีเดิมที่อยู่ในศาลทหาร ไม่สามารถโอนมาศาลปกติได้  เนื่องจากบางคดีก็มีการสืบพยานไปแล้ว หากโอนกลับมาจะทำให้เกิดความยุ่งยาก